Определение плазмиды
Плазмида – это маленький круглый ДНК, отличающийся от хромосомной ДНК, которая является генетическим материалом, обнаруженным в организм Хромосомы. Он реплицируется независимо от хромосомной ДНК. Плазмиды в основном находятся в бактерии, но они также могут быть найдены в архее и многоклеточный организмы. Плазмиды обычно несут по крайней мере один ген и многие из генов, которые несут плазмиды, полезны для их организмов-хозяев. Хотя они имеют отдельные гены от своих хозяев, они не считаются независимой жизнью.
Функции плазмид
Плазмиды имеют много разных функций. Они могут содержать гены, которые увеличивают выживание организма, убивая других организмов или защищая хозяина клетка производя токсины. Некоторые плазмиды облегчают процесс репликации в бактериях. Поскольку плазмиды настолько малы, они обычно содержат только несколько генов со специфической функцией (в отличие от большого количества некодирующей ДНК). Несколько плазмид могут сосуществовать в одной и той же клетке, каждая с различными функциями. Функции более подробно описаны в разделе «Конкретные типы плазмид» ниже.
Общие типы плазмид
Конъюгированные и неконъюгированные
Существует много способов классификации плазмид от общих до специфических. Один из способов состоит в том, чтобы сгруппировать их как сопряженные или не сопряженные. Бактерии размножаются путем полового конъюгирования, которое представляет собой передачу генетического материала из одной бактериальной клетки в другую, либо через прямой контакт, либо через мост между двумя клетками. Некоторые плазмиды содержат гены, называемые переносящими генами, которые облегчают начало конъюгации. Неконъюгативные плазмиды не могут начать процесс конъюгации, и они могут быть переданы только посредством полового конъюгации с помощью конъюгативных плазмид.
несовместимость
Другая классификация плазмид относится к группе несовместимости. В бактерии разные плазмиды могут сосуществовать, только если они совместимы друг с другом. Несовместимая плазмида будет удалена из бактериальной клетки. Плазмиды несовместимы, если они имеют одинаковую стратегию размножения в клетке; это позволяет плазмидам заселять определенную территорию внутри нее без вмешательства других плазмид.
Конкретные типы плазмид
Существует пять основных типов плазмид: F-плазмиды фертильности, плазмиды устойчивости, плазмиды вирулентности, деградирующие плазмиды и плазмиды Col.
Плодородие F-плазмиды
Плазмиды фертильности, также известные как F-плазмиды, содержат переносящие гены, которые позволяют переносить гены от одной бактерии к другой через конъюгацию. Они составляют широкую категорию конъюгативных плазмид. F-плазмиды представляют собой эпизоды, которые являются плазмидами, которые могут быть встроены в хромосомную ДНК. Бактерии, которые имеют F-плазмиду, известны как F-положительные (F +), а бактерии без нее – F-отрицательные (F–). Когда бактерия F + конъюгирует с бактерией F–, образуются две бактерии F +. В каждой бактерии может быть только одна F-плазмида.
Плазмиды сопротивления
Резистентные или R-плазмиды содержат гены, которые помогают бактериальной клетке защищаться от факторов окружающей среды, таких как яды или антибиотики. Некоторые резистентные плазмиды могут переносить себя посредством конъюгации. Когда это происходит, штамм бактерий может стать устойчивым к антибиотикам. В последнее время тип бактерии, вызывающей гонорею, передаваемую половым путем, стал настолько устойчивым к классу антибиотиков, называемых хинолонами, что Всемирная организация здравоохранения начала рекомендовать новый класс антибиотиков, называемый цефалоспоринами. Бактерии могут даже стать устойчивыми к этим антибиотикам в течение пяти лет. Согласно NPR, чрезмерное использование антибиотиков для лечения других инфекций, таких как инфекции мочевыводящих путей, может привести к распространению устойчивых к лекарствам штаммов.
Плазмиды вирулентности
Когда плазмида вирулентности находится внутри бактерии, она превращает эту бактерию в патоген, который является возбудителем болезни. Бактерии, вызывающие заболевание, могут легко распространяться и размножаться среди пораженных людей. Бактерия Escherichia coli (E.coli) имеет несколько плазмид вирулентности. Кишечная палочка естественным образом обнаруживается в кишечнике человека и у других животных, но некоторые штаммы кишечной палочки могут вызывать сильную диарею и рвоту. Salmonella enterica – еще одна бактерия, которая содержит плазмиды вирулентности.
Разлагающие плазмиды
Разлагающие плазмиды помогают бактерии-хозяину переваривать соединения, которые обычно не встречаются в природе, такие как камфора, ксилол, толуол и салициловая кислота. Эти плазмиды содержат гены для специальных ферментов, которые расщепляют определенные соединения. Деградирующие плазмиды являются конъюгативными.
Col плазмиды
Col-плазмиды содержат гены, которые вырабатывают бактериоцины (также известные как колицины), которые являются белками, которые убивают другие бактерии и таким образом защищают бактерию-хозяина. Бактериоцины обнаружены во многих типах бактерий, включая кишечную палочку, которая получает их из плазмиды ColE1.
Применение плазмид
Люди разработали множество способов использования плазмид и создали программное обеспечение для записи последовательностей ДНК плазмид для использования во многих различных методах. Плазмиды используются в генная инженерия усиливать или производить много копий определенных генов. В молекулярном клонировании плазмида является типом вектора. Вектор представляет собой последовательность ДНК, которая может транспортировать чужеродный генетический материал из одной клетки в другую, где гены могут быть дополнительно экспрессированы и реплицированы. Плазмиды полезны при клонировании коротких сегментов ДНК. Также плазмиды можно использовать для репликации белков, таких как белок, который кодирует инсулин, в больших количествах. Кроме того, плазмиды исследуются как способ переноса генов в клетки человека в рамках генной терапии. В клетках может отсутствовать специфический белок, если у пациента есть наследственное заболевание с участием гена мутация, Вставка плазмиды в ДНК позволит клеткам экспрессировать белок, которого им не хватает.
- бактерии – одноклеточные микробы, которые были одним из первых типов жизненных форм, которые эволюционировали на Земле; они могут существовать независимо или внутри других организмов.
- эписома – У бактерий плазмида, которая может быть вставлена в хромосома, У эукариот плазмида относится к нехромосомной ДНК, которая может реплицироваться в ядре, например вирус,
- сопряженный – категория плазмид, запускающих процесс полового конъюгации у бактерий.
- бактериоциновые – белок, продуцируемый плазмидой в бактерии, которая убивает другие бактерии близкородственного штамма.
викторина
1. Какой НЕ является одним из пяти основных типов плазмид?A. Плодородие F-плазмидыB. ДНК плазмидыC. Col плазмидыD. Плазмиды вирулентности
Ответ на вопрос № 1
В верно. К пяти основным типам плазмид относятся F-плазмиды фертильности, плазмиды Col, плазмиды вирулентности, деградирующие плазмиды и плазмиды устойчивости. Все плазмиды состоят из ДНК.
2. Что такое неконъюгативная плазмида?A. Плазмида, которая не может быть воспроизведенаB. Плазмида, которая не может вызвать процесс полового конъюгацииC. Плазмида, которая кодирует токсины, которые убивают конъюгативные плазмидыD. Плазмида, которая предотвращает процесс полового конъюгации
Ответ на вопрос № 2
В верно. Неконъюгирующая плазмида не может сама начать половое сопряжение; он должен полагаться на конъюгативные плазмиды, которые могут запустить этот процесс, для репликации.
3. Что делают деградирующие плазмиды?A. Запустите процесс репликации с их генами передачиB. Убить бактерии близкородственного штаммаC. Превратите бактерии-хозяева в патогенD. Расщепление необычных соединений в окружающей среде клетки
Ответ на вопрос № 3
D верно. Деградирующие плазмиды кодируют ферменты, которые помогают переваривать необычные соединения, такие как салициловая кислота. Выбор A является функцией F-плазмид фертильности, B является функцией плазмид Col, а C является функцией плазмид вирулентности.